Protein–RNA interactions for Protein: Q99742

NPAS1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS1Q99742 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NPAS1Q99742 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms