Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SLC35A4Q96G79 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SLC35A4Q96G79 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms