Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRIM41Q8WV44 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TRIM41Q8WV44 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms