Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z9

VSIG10, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10Q8N0Z9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
VSIG10Q8N0Z9 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG10Q8N0Z9 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms