Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2R2

PDSS1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1Q5T2R2 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PDSS1Q5T2R2 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms