Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Syne3Q4FZC9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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