Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KRTAP21-3Q3LHN1 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms