Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PKP1Q13835 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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