Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Msx2Q03358 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Msx2Q03358 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms