Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tmod1P49813 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms