Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CFAP61-203ENST00000377293 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC01066-201ENST00000415283 399 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC074367.1-201ENST00000438685 1125 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LHFPL3-AS1-206ENST00000449764 1196 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DTWD1-205ENST00000558653 1131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DPP4-211ENST00000628861 433 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AL162425.1-201ENST00000423637 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 ZNF839P1-201ENST00000403487 861 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC092669.1-202ENST00000449673 905 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC00370-201ENST00000455487 698 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PRSS58-202ENST00000552471 1123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 HNRNPA3P11-201ENST00000564298 934 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC087072.2-201ENST00000621060 682 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HOXD11P31277 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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