Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ZNRF3Q9ULT6 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms