Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL52

TMPRSS11E, Transmembrane protease serine 11E, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11EQ9UL52 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TMPRSS11EQ9UL52 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TMPRSS11EQ9UL52 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms