Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
TMPRSS4Q9NRS4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms