Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C11orf49Q9H6J7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C11orf49Q9H6J7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms