Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCDC7Q96M83 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCDC7Q96M83 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms