Protein–RNA interactions for Protein: Q96B97

SH3KBP1, SH3 domain-containing kinase-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3KBP1Q96B97 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SH3KBP1Q96B97 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms