Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 2,179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
FREM1Q5H8C1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
FREM1Q5H8C1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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