Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
NTRK2Q16620 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NTRK2Q16620 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms