Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PUM3Q15397 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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PUM3Q15397 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PUM3Q15397 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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