Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
FOXF2Q12947 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOXF2Q12947 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms