Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TNFRSF17Q02223 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms