Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COX5BP10606 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COX5BP10606 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COX5BP10606 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
COX5BP10606 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
COX5BP10606 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms