Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CACNA1GO43497 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CACNA1GO43497 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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