Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PHF1O43189 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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PHF1O43189 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PHF1O43189 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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