Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ERVV-1B6SEH8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ERVV-1B6SEH8 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms