Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RHBDD3Q9Y3P4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms