Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CYTH4Q9UIA0 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms