Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FANCFQ9NPI8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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