Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY77

POLDIP3, Polymerase delta-interacting protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLDIP3Q9BY77 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLDIP3Q9BY77 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLDIP3Q9BY77 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms