Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SNHG12Q9BXW3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms