Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
TMEM43Q9BTV4 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TMEM43Q9BTV4 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms