Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf40Q8IXQ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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