Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RAPSNQ13702 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms