Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CUL1Q13616 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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