Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PEX6Q13608 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PEX6Q13608 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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