Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SELENBP1Q13228 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms