Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CCDC15Q0P6D6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms