Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SOX4Q06945 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SOX4Q06945 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms