Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CALD1Q05682 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms