Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPTBN1Q01082 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms