Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PGGT1BP53609 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PGGT1BP53609 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
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