Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 AC146944.2-201ENST00000504546 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC139495.1-201ENST00000510264 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 IZUMO3-202ENST00000543880 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.60-201ENST00000616888 305 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SERPING1-213ENST00000619430 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NPSR1-208ENST00000465305 814 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 BAALC-AS1-202ENST00000500902 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC005972.1-201ENST00000581596 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 TM2D3-202ENST00000347970 1329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FYTTD1-203ENST00000415708 1342 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CTXN3-202ENST00000395322 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 OR4C12-201ENST00000335238 1063 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PHF6-203ENST00000370800 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FRG2FP-202ENST00000419104 559 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
HOXD11P31277 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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