Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf172C9J069 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms