Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
KLHL11Q9NVR0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms