Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SGIP1Q9BQI5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms