Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BORCS6Q96GS4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms