Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CCDC97Q96F63 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms