Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM41Q8WV44 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM41Q8WV44 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms