Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ZNF248Q8NDW4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
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ZNF248Q8NDW4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ZNF248Q8NDW4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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